Bonjour, je suis Jérémy Semhoun
Biologiste Informaticien.

J'ai plus de dix ans d'expérience. J'ai travaillé sur le NGS (Next Generation Sequencing) en Whole Genome, Whole Exome ou RNA Seq. J'ai fait de la recherche de transcrits chimériques. J'ai aussi travaillé sur la prediction de épitope in silico .

Fiche info

  • NomJérémy Semhoun
  • Date de naissance07 Octobre 1982
  • E-mail
  • LieuParis
  • Téléphone
  • Site Webwww.jsemhoun.fr

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Curiculum Vitæ

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Experiences

  • Centre Étude du Polymorphisme Humain – Fondation Jean Dausset www.cephb.fr
    2009 - Aujourd'hui

    Ingénieur en Biologie - Informatique.
    Mise en place de pipeline NGS. Benchmark d'outils Bio-informatique.

  • Commissariat à l’Energie Atomique www.cea.fr
    2008

    Analyse et développement bio-informatique.
    Associés à une equipe de Biologiste pour la mise en place d'outils des outils bio-informatique du laboratoire.

  • Centre National de Recherche en Génétique Humaine www.cng.fr
    2005 – 2007

    Analyse et développement bio-informatique en spectrométrie de masse.
    Application de la bio-informatique pour l'identification des fragments et application à l'ADN/ARN

  • Stage à l’INRS – Institut Armand-Frappier (Quebec, CANADA) www.iaf.inrs.ca
    Printemps 2001

    Encapsulation de micronutriments et analyse de leur conservation

Compétences

  • Pipeline NGS 81%

  • Immunologie in silico 64%

  • C/Java 52%

  • Python/Perl 78%

  • Suite Ms Office 83%

Atouts

  • Medecine personnalisée
  • Développement
  • Veille technologique
  • Travail d'équipe
  • Biologie
  • Serveur de Calcul

Formation

  • Université Paris VII - Master Recherche (DEA) de Biologie-Informatique
    2004 - 2005

    Mention Bien

  • Université Paris VII - Maîtrise de Biologie-Informatique
    2003 - 2004

    Mention Bien - Major de Promotion

  • Université Paris VII - Licence de Biologie-Informatique
    2002 - 2003

    Mention Très Bien - Major de Promotion

  • Ecole Nationale de Chimie Physique Biologie BTS de Biotechnologie
    2000 - 2002

A Emporter

  • Version Francaise
  • English Version

Publications

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Publications

  • Variation in genomic landscape of clear cell renal cell carcinoma across Europe.
    Nature Communication

    2014 Oct 29;5:5135. doi: 10.1038/ncomms6135

  • Ribo-polymerase chain reaction--a facile method for the preparation of chimeric RNA/DNA applied to DNA sequencing.
    Human Mutation

    2012 Jun;33(6):1010-5. doi: 10.1002/humu.22061. Epub 2012 Apr 4.

  • DNA sequencing by MALDI-TOF MS using alkali cleavage of RNA/DNA chimeras.
    Nucleic Acids Research

    2007;35(8):e62. Epub 2007 Apr 10.

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